Le LIRA est dirigé par une équipe de direction constituée depuis janvier 2025 de :
- Milan Maksimovic, directeur ;
- Paola Di Matteo, directrice adjointe ;
- Alain Doressoundiram, directeur adjoint ;
- Thibaut Paumard, directeur adjoint ;
- Jean-Michel Krieg, directeur technique ;
- Florence Henry, directrice technique adjointe ;
- Arnaud Pès, responsable administratif du laboratoire, remplissant également le rôle de :
- Secrétaire général,
- Chef du personnel.
La coordination des équipes et le dialogue avec la direction du laboratoire est assurée via une organisation des personnels en pôles.
On compte ainsi 5 pôles scientifiques :
- Étoiles et galaxies (co-responsables : François Hammer et Jordan Philidet) ;
- Haute résolution angulaire en astrophysique (HRAA) (co-responsables : Elsa Huby et Mathias Nowak) ;
- Héliosphère et Plasmas Astrophysiques (HPA) (co-responsables : Léa Griton et Arnaud Zaslavsky) ;
- Planétologie (co-responsables : Nicolas Biver et François Dulieu) ;
- Systèmes Exoplanétaires (co-responsables : Benjamin Charney et Johan Mazoyer) ;
ainsi que les pôles :
- Technique (directeur technique : Jean-Michel Krieg, directrice technique adjointe : Florence Henry) ;
- Secrétariat général (responsable : Arnaud Pès).
Il existe ainsi une structure de direction élargie regroupant la direction du laboratoire et les coordinateurs de pôles et permettant d’assurer un pilotage concerté du laboratoire.